Movable Type 4.2 から、Movable Type 5.01 へアップグレードしました。
Movable Type の内部構造がかわり、Movable Type 5.0 の変更点、注意事項、および既知の問題 | Movable Type 5 ドキュメントにもあるように、
Feeds.App Liteで外部のフィードを取得するときに、文字化けすることがあります。
という問題点があるため、このサイトでもBBSのFeedをFeeds.App Liteで表示させている部部分が文字化けを起こしていますが、それ以外では問題がなさそうです。
コメントのテストです。5.0でテストしたところ上手く移行できなかったウェブサイトも問題なく移行しました。